Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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