Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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