Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRKQ15262 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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