Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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