Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IHHQ14623 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IHHQ14623 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IHHQ14623 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IHHQ14623 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IHHQ14623 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IHHQ14623 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IHHQ14623 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IHHQ14623 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IHHQ14623 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IHHQ14623 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms