Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 Metazoa_SRP.58-201ENST00000618720 282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 TMEM161B-207ENST00000509387 963 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CAMK2BQ13554 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CAMK2BQ13554 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CAMK2BQ13554 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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