Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms