Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FCRLA-203ENST00000309691 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 THUMPD1P1-201ENST00000400014 1041 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL513123.1-201ENST00000415883 597 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ASPA-202ENST00000456349 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC025171.2-201ENST00000451894 1218 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ZNF528-AS1-204ENST00000601562 1069 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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