Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMAN2Q12907 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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