Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TROQ12816 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TROQ12816 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TROQ12816 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TROQ12816 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TROQ12816 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TROQ12816 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TROQ12816 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TROQ12816 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TROQ12816 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TROQ12816 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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