Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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