Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F3Q08477 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms