Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SH3YL1-204ENST00000403658 1279 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GEMIN2-202ENST00000308317 1420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LINC02071-201ENST00000514726 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TP53-208ENST00000504290 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TP53-220ENST00000610623 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CASC20-201ENST00000415932 1484 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms