Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms