Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms