Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms