Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PPCS-204ENST00000372562 966 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC113143.1-201ENST00000534670 301 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AP003717.2-201ENST00000534962 898 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC107241.1-201ENST00000560280 434 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC009075.2-201ENST00000568483 301 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GIMAP2-201ENST00000223293 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NPM1P50-201ENST00000532878 867 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms