Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms