Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTHL1P78549 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms