Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP46P62068 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP46P62068 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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