Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOSBP53539 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOSBP53539 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOSBP53539 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms