Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA2P51531 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms