Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms