Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP4P49662 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms