Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms