Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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