Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms