Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC9A1P19634 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms