Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN1P18031 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms