Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms