Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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