Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSF2P04141 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSF2P04141 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSF2P04141 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSF2P04141 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSF2P04141 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSF2P04141 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSF2P04141 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSF2P04141 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSF2P04141 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSF2P04141 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSF2P04141 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSF2P04141 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSF2P04141 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSF2P04141 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSF2P04141 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms