Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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MTSS1O43312 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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MTSS1O43312 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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MTSS1O43312 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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MTSS1O43312 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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MTSS1O43312 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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MTSS1O43312 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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