Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms