Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms