Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIT1Q9Y2X7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIT1Q9Y2X7 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIT1Q9Y2X7 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIT1Q9Y2X7 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIT1Q9Y2X7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIT1Q9Y2X7 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIT1Q9Y2X7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIT1Q9Y2X7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIT1Q9Y2X7 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIT1Q9Y2X7 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIT1Q9Y2X7 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms