Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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