Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX16Q9P0S2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX16Q9P0S2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX16Q9P0S2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX16Q9P0S2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX16Q9P0S2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX16Q9P0S2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX16Q9P0S2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX16Q9P0S2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX16Q9P0S2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX16Q9P0S2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX16Q9P0S2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX16Q9P0S2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms