Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms