Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLXNA4Q9HCM2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms