Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZW8

MS4A7, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A7Q9GZW8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms