Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms