Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YME1L1Q96TA2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YME1L1Q96TA2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YME1L1Q96TA2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YME1L1Q96TA2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YME1L1Q96TA2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YME1L1Q96TA2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YME1L1Q96TA2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YME1L1Q96TA2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YME1L1Q96TA2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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YME1L1Q96TA2 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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YME1L1Q96TA2 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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YME1L1Q96TA2 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YME1L1Q96TA2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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