Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms