Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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