Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms