Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms