Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRT1Q96EB6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms