Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EDAQ92838 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EDAQ92838 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EDAQ92838 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EDAQ92838 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms