Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAS9

C5orf17, Uncharacterized protein C5orf17, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf17Q8NAS9 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms